Modifications de l’analyse d’échantillons de selles au laboratoire de Santé publique Ontario

Destinataires : Médecins et personnel infirmier praticien d’Ottawa
Date : Le 5 janvier 2026
Expéditrice : Dre Michelle Foote, médecin adjointe en santé publique
Objet : Modifications de l’analyse d’échantillons de selles au laboratoire de Santé publique Ontario

Chers collègues,

L’information suivante a été résumée à partir d’un courriel (disponible en anglais seulement) de santé publique Ontario.

Le 15 décembre 2025, Santé publique Ontario a mis en place un test de détection moléculaire (test d’amplification en chaîne par polymérase [PCR]) pour remplacer la microscopie dans la détection des protozoaires entériques dans les échantillons de selles. Le nouveau test PCR détecte 5 protozoaires : Cryptosporidium, Cyclospora, Dientamoeba fragilis, Entamoeba histolytica, et Giardia duodenalis.

Les échantillons soumis à un test PCR seront testés UNIQUEMENT si la demande indique l’un des éléments suivants. Autrement, les demandes seront annulées :

• Signes ou symptômes compatibles avec une infection par un protozoaire entérique (p. ex. diarrhée);
• Contact étroit avec une personne infectée (p. ex. dans un ménage ou dans une grappe d’éclosion).

Échantillons acceptés pour les tests PCR : Selles dans un milieu de transport Cary‑Blair (p. ex. Copan FecalSwab ou un autre milieu de transport Cary‑Blair). Il est également possible d’utiliser des selles non conservées dans un flacon vide stérile, mais cela est moins préférable.

Échantillons refusés pour les tests PCR : Les selles dans l’acétate de sodium, l’acide acétique et le formol (SAF) ne conviennent PAS aux tests PCR; ces échantillons seront donc refusés.

La microscopie restera une option pour les parasites ne pouvant pas faire l’objet d’un test PCR tels que d’autres apicomplexes (p. ex. Cystoisospora, Sarcocystis), les Balantioides, les helminthes (p. ex. ovules, larves), les microsporidioses (p. ex. Enterocytozoon, Encephalitozoon), et les vers visibles. La microscopie sera effectuée UNIQUEMENT si la demande indique l’un des éléments suivants. Autrement, les demandes seront annulées :

• Déficience du système immunitaire (p. ex. VIH, greffe, stéroïdes);
• Voyage ou migration internationale;
• Exposition au bétail (p. ex. fermière ou fermier);
• Ingestion de fruits de mer, d’amphibiens, de reptiles ou de gastéropodes insuffisamment cuits;
• Éosinophilie inexpliquée;
• Test sérologique positif connu pour une infection parasitaire (préciser quel organisme);
• Contact étroit avec une personne infectée (p. ex. dans un ménage ou dans une grappe d’éclosion).

Important: À compter du 31 janvier 2026, toutes les demandes de microscopie ne comportant pas ces renseignements seront annulées. En cas d’annulation, si la microscopie est toujours cliniquement indiquée, un autre échantillon de selles devra être prélevé et soumis, lequel devra être accompagné des renseignements appropriés liés à la demande.

Échantillons acceptés pour la microscopie : Selles dans un flacon contenant de l’acétate de sodium, de l’acide acétique et du formol (SAF). La demande doit indiquer le type d’organisme soupçonné (p. ex. apicomplexe, helminthe ou microsporidiose) selon le tableau clinique et les antécédents d’exposition.

Échantillons refusés pour la microscopie : Les selles dans un milieu de transport Cary-Blair ou non conservées dans un flacon ne conviennent PAS à la microscopie.

Pour obtenir de plus amples renseignements sur les tests, veuillez consulter les pages Web du laboratoire de Santé publique Ontario suivantes (disponible en anglais seulement) :

• Enteric Protozoa (Cryptosporidium, Cyclospora, Dientamoeba, Entamoeba, and Giardia) – PCR [Protozoaires entériques (Cryptosporidium, Cyclospora, Dientamoeba, Entamoeba et Giardia) – Test PCR]
• Enteric Helminths (Nematodes, Trematodes, Cestodes, Acanthocephalans) and Balantiodes – Microscopy [Helminthes entériques (nématodes, trématodes, cestodes, acanthocéphales) et balantidioses – Microscopie]
• Microsporidia (Microsporidiosis) – Microscopy and PCR [Microsporidia (Microsporidioses) – Microscopie et test PCR]
• Sarcocystis (Sarcocystosis) – Microscopy [Sarcocystis (Sarcocyste) – Microscopie]
• Cystoisospora (Cystoisosporiasis) – Microscopy [Cystoisospora (Cystoisosporiose)–Microscopie]
• Enterobius (Pinworm) – Microscopy [Enterobius (oxyure) – Microscopie]
• Clonorchis (Clonorchiasis) – Microscopy and Antibody [Clonorchis (clonorchiase) – Microscopie et anticorps]
• Fasciola (Fascioliasis) – Microscopy and Antibody [Fasciola (Fasciolose) – Microscopie et anticorps]
• Paragonimus (Paragonimiasis) – Microscopy and Antibody [Paragonimus (Paragonimiase) – Microscopie et anticorps]
• Schistosoma (Schistosomiasis) – Microscopy, Antibody, and Antigen [Schistosoma (Schistosomiase) – Microscopie, anticorps et antigène]
• Strongyloides (Strongyloidiasis) – Microscopy and Antibody [Strongyloïdes (anguillulose) – Microscopie et anticorps]
• Taenia solium (Cysticercosis) – Antibody and PCR [Taenia solium (Cysticercose) – Anticorps et test PCR]
• Extraintestinal Entamoeba histolytica (Amebic Abscess) – Microscopy, PCR, and Antibody [Entamoeba histolytica extraintestinal (abcès amibien) – Microscopie, test PCR et anticorps]
• Worm (Whole or Segment) – Identification [Ver (entier ou segment) – Identification]

Pour toute question concernant les renseignements sur les tests susmentionnés, veuillez communiquer avec le Centre de service à la clientèle du laboratoire de Santé publique Ontario, en composant le 1 877 604-4567 (sans frais) ou le 416-235-6556, ou en envoyant un courriel à l’adresse CustomerServiceCentre@oahpp.ca.